In het Modoma project (2021-2023) hebben Floricode, Naktuinbouw en Biometris/WUR de mogelijkheden onderzocht van automatische identificatie van bloemkenmerken in rozen en gerbera’s, op grond van beelden. Deze beelden worden door toepassing van AI gelinkt aan de databases waarin de kenmerken zijn opgeslagen. Om een overzicht te krijgen van de inhoud van die databases is een app ontwikkeld op basis van R/Shiny. Met deze app kun je in je browser een overzicht van de kenmerken bekijken, je kunt records vergelijken, en je kunt een set waardes definieren voor een subset van de kenmerken, en dan kijken welke records daar het meest op lijken.
Er is een demo app beschikbaar via https://shiny.wur.nl/modoma.
In deze app is de Floricode Gerbera data al ingelezen en kan snel een overzicht worden gekregen van de mogelijkheden van de app. Voor een uitgebreidere versie waarin ook eigen datasets kunnen worden ingelezen, moet de app gedraaid worden zoals hieronder bij installatie beschreven.
Handleidingen
Er zijn twee handleidingen beschikbaar voor de app.
Voor een overzicht van functionaliteiten en het gebruik van de app in het algemeen: https://biometris.github.io/modoma/articles/Manual.html
Voor een uitgebreide beschrijving voor het gebruik van een eigen dataset binnen de app: https://biometris.github.io/modoma/articles/Metadata.html
Installatie
De installatie van de app kan worden gedaan in een paar eenvoudige stappen:
Installeer R op je computer. Uitgebreide instructies voor alle besturingssystemen zijn te vinden op https://cran.r-project.org/. Voor Windows komt het er op neer dat je de installatie-executable downloadt voor de meest recente versie van R (op het moment van schrijven https://cran.r-project.org/bin/windows/base/R-4.3.0-win.exe) en installeert door te dubbelklikken - binnen een beschermde omgeving kan het zijn dat IT support daarbij moet helpen voor de permissies.
Start R op, en installeer het modoma pakket door op de command line het volgende te draaien:
install.packages("remotes")
remotes::install_github("Biometris/modoma", dependencies = TRUE)- Nu is het modoma pakket beschikbaar. Het kan worden opgeroepen door het volgende commando in R te geven:
library(modoma)- Tenslotte wordt de webpagina geopend door het volgende commando:
launch()